Toaru Majutsu no Index Season 3 - Touma Kamijou tidak bisa istirahat. Setelah invasi Akademi City, ketegangan politik terus meningkat karena kedua faksi ilmu pengetahuan dan sihir bertabrakan kepala pada. Tampaknya Academy City bermaksud menyatakan perang melawan Gereja Katolik Roma, akibatnya memasukkan seluruh dunia ke dalam perang global. Touma menemukan dirinya di garis depan sekali lagi, berjuang untuk melindungi teman-temannya dan sekutu-sekutunya. Toaru Majutsu no Index III berfungsi sebagai cicilan terakhir dari waralaba asli sebagai Touma, Akselerator, dan Tingkat 0 Shiage Hamazura melanjutkan perjalanan terpisah mereka, memimpin aksi akhir dari seri novel cahaya asli.