Nande Koko ni Sensei ga!? - siswa SMA kedua Ichirou Satou selalu menjadi orang rata-rata - yaitu, sampai ia berjalan ke beberapa tidak-jadi situasi rata-rata dengan gurunya, Kana "Iblis" Kojima. Kojima adalah guru bahasa Satou Jepang dengan reputasi begitu kejam bahkan anak nakal sekolah pun tunduk padanya. Suatu hari yang menentukan, hal-hal meningkat ketika Satou berjalan ke Kojima di kamar mandi, membawa mereka untuk berbagi hubungan intim yang membuat imajinasinya berjalan liar selama berhari-hari setelah. Nande Koko ni Sensei ga? mengikuti kehidupan sehari-hari Satou dan gurunya karena mereka terus bertemu dalam kondisi yang sama, tumbuh semakin dekat dengan setiap pertemuan.