Meitantei Conan - Shinichi Kudou, seorang siswa SMA yang memiliki bakat luar biasa dalam pekerjaan detektif, dikenal juga telah memecahkan beberapa kasus yang menantang. Suatu hari, ketika Shinichi melihat dua orang mencurigakan dan memutuskan untuk mengikuti mereka, dia tidak sengaja menjadi saksi kegiatan ilegal yang mengganggu. Sayangnya, ia tertangkap dalam tindakan, sehingga orang-orang dosis dia dengan obat eksperimental diformulasikan oleh organisasi kriminal mereka, meninggalkan dia sampai mati. Namun, untuk heran sendiri, Shinichi hidup untuk melihat hari lain, tapi sekarang dalam tubuh seorang anak tujuh tahun. Sangat menjaga kecerdasan aslinya, dia menyembunyikan identitas aslinya dari semua orang, termasuk teman masa kecilnya Ran Mouri dan ayahnya, detektif swasta Kogorou Mouri. Untuk ini, ia mengambil alias Conan Edogawa, terinspirasi oleh penulis misteri Arthur Conan Doyle dan Ranpo Edogawa. Shinichi, sebagai Conan, mulai secara diam-diam memecahkan kasus senior Mouri dari belakang layar dengan keterampilan yang masih luar biasa penyelidikan organisasi bertanggung jawab atas keadaannya saat ini, berharap untuk membalikkan efek obat suatu hari nanti.