Made in Abyss - The Abyss - jurang menganga membentang turun ke kedalaman bumi, penuh dengan makhluk misterius dan peninggalan dari masa lalu yang lama. Bagaimana bisa? Apa yang terletak di bagian bawah? Tak terhitung berani individu, dikenal sebagai Divers, telah berusaha untuk memecahkan misteri ini Abyss, takut turun ke alam gelap. Yang terbaik dan paling berani dari Para Penyelam, Peluit Putih, dipuji sebagai legenda oleh mereka yang tetap di permukaan. Rico, putri yang hilang dari Whistle Putih Lyza sang Annihilator, bercita-cita untuk menjadi seperti ibunya dan menjelajahi jangkauan terjauh dari Abyss. Namun, hanya pemula Red Whistle sendiri, dia hanya diizinkan untuk berkeliaran lapisan yang paling atas. Meski begitu, Rico memiliki kesempatan bertemu dengan robot misterius dengan penampilan seorang anak muda biasa. Dia datang untuk menamainya Reg, dan dia tidak ingat kejadian sebelum penemuannya. Tentu saja teknologi untuk menciptakan Reg harus datang dari dalam Abyss, dua memutuskan untuk berani maju ke jurang untuk memulihkan ingatannya dan melihat bagian bawah lubang besar dengan mata mereka sendiri. Namun, mereka tidak tahu dari kenyataan keras yang adalah keberadaan sejati Abyss.