Little Busters! Season 2 - Setelah Little Busters setelah mereka kehilangan pertandingan baseball pertama mereka, tim memutuskan untuk mengadakan pesta pancake. Sudah hampir satu semester sejak kembalinya Kyousuke Natsume. Seperti biasa, Riki Naoe terus membantu anggota Little Busters '- baik tua dan baru - dengan menghadapi perjuangan batin mereka. Namun, kejadian aneh mulai terjadi, membuat Rin Natsume dan Riki semakin dekat mengungkap kebenaran dibalik "rahasia dunia ini". Rin dan Rikki tahu, penemuan mereka akan berakhir dengan perubahan kehidupan sehari-hari yang damai yang diciptakan oleh Little Busters sekali dan untuk selamanya. Little Busters! Refrain membawa kesimpulan untuk cerita-cerita berwarna-warni yang terkait - ditempa dengan berat emosi dan diperkuat dengan ikatan persahabatan - karena mereka datang untuk berdamai dengan penyesalan mereka dan kelemahan.