Grisaia no Kajitsu - Yuuji Kazami adalah murid pindahan yang baru saja diterima di Akademi Mihama. Dia ingin menjalani kehidupan SMA biasa, tapi mimpi ini mungkin tidak menjadi kenyataan setiap saat segera setelah Mihama Academy justru sebaliknya. Menganggap hanya kepala sekolah dan lima siswa lainnya, semuanya adalah anak perempuan, Yuuji menjadi berkenalan dengan masing-masing, menemukan lebih banyak tentang kepribadian mereka sebagai sosialisasi tidak terelakkan. Perlahan-lahan, ia mulai belajar tentang kebenaran di belakang kelompok kecil mahasiswa menempati akademi - mereka masing-masing memiliki berbagi sendiri pengalaman traumatis yang tersimpan jauh dari dunia. Mihama Akademi bertindak sebagai rumah untuk gadis-gadis ini, mereka adalah "buah" yang jatuh dari pohon mereka dan telah mulai membusuk. Ini tergantung Yuuji untuk menjadi katalis untuk menyelamatkan mereka dari diri mereka sendiri, tapi bagaimana dia bisa menyelamatkan orang lain ketika ia bahkan tidak bisa menyelamatkan dirinya sendiri?