Fumetsu no Anata e Season 3 - Ratusan tahun setelah pertempuran skala besar melawan Nokkers di kota Renril, dunia tidak dikenali. Berkat upaya Fushi yang abadi dalam dormancy, ia telah berhasil menciptakan dunia dengan infrastruktur modern di mana ia dan setiap spesies hidup dapat hidup dalam damai. Ketika ia akhirnya terbangun dari tidurnya, Fushi gembira untuk mencoba segala sesuatu yang dunia baru ini telah menawarkan dan menghidupkan kembali teman-temannya dari masa lalu. Sementara menjelajah, Fushi berlari ke Yuuki Aoki, seorang siswa SMP yang hidup, yang cepat menyambut dia dan teman-temannya ke dalam rumah. Sebagai kelompok menetap ke rumah baru mereka dan belajar lebih banyak tentang dunia modern, Fushi bertemu Mizuha, teman Yuuki, yang menyerupai seseorang yang akrab dengannya. Ternyata Mizuha adalah keturunan Penjaga: orang-orang yang tujuannya hanya untuk menjaga Fushi. Seperti nenek moyangnya, ia tumbuh menyukai Fushi, yang mencerahkan hidupnya. Namun, sebagai peristiwa aneh terjadi ketika Mizuha mendekati Fushi, menjadi jelas bahwa dunia baru ini jauh dari sempurna.