Fate/Zero Season 2 - Saat Perang Cawan Suci Keempat berkecamuk tanpa ada pemenang yang terlihat jelas, para pelayan yang tersisa dan Master mereka dipanggil oleh pengawas Gereja Risei Kotomine, untuk bersatu dan menghadapi ancaman yang akan datang yang dapat mengungkap Perang Grail dan membawa kehancuran kota Fuyuki. Gencatan senjata tak tenang segera runtuh sebagai Master menunjukkan bahwa mereka akan melakukan apa pun dalam kekuasaan mereka, tidak peduli seberapa tercela, untuk menang. Benih keraguan adalah taburan antara Kiritsugu Emiya dan Saber, pembantunya, sebagai ideologi konflik mereka tentang kepahlawanan dan pertempuran ksatria. Sementara itu, sebuah bentuk ikatan yang menyenangkan antara Kirei Kotomine, yang masih berusaha untuk menemukan tujuannya dalam hidup, dan salah satu pelayan yang tersisa. Sebagai hitungan mundur untuk akhir perang mencapai nol, biaya kemenangan mulai mengaburkan garis antara kemenangan dan kekalahan.